1 сентября 1961 года решением исполнительного комитета Смоленского областного Совета было создано Управление капитального строительства облисполкома, которое финансировало и контролировало строительство всех объектов образования и здравоохранения области. При самом активном участии Управления капитального строительства Смоленской области в качестве государственного Заказчика были построены десятки школ, больниц, детских садов, спортивных и других объектов социальной инфраструктуры. Управление сыграло большую роль в развитии и становлении строительной отрасли в Смоленской области.

В течение всего периода своего существования УКС претерпело ряд организационных изменений. 1 января 1992 года учреждение было преобразовано в Бюро строительства "Смоленскоблстройзаказчик", с 15 сентября 1992 года — в Государственное предприятие "Смоленскоблстройзаказчик", с 30 августа 1993 года — в "Управление капитального строительства Администрации Смоленской области". В мае 2004 года на основании распоряжения Администрации Смоленской области № 349-р/адм учреждение было упразднено.

Современное областное государственное бюджетное учреждение "Управление капитального строительства Смоленской области" является подведомственным учреждением Министерства архитектуры и строительства Смоленской области и создано на основании распоряжения от 4 февраля 2009 года N 76-р/адм, сохранив свою основную цель деятельности — осуществление функций заказчика-застройщика и строительного контроля при строительстве объектов капитального строительства на территории Смоленской области.